Когда в апреле 1861 г. началась Гражданская война между Севером и Югом Соединенных Штатов, то у южан не оставалось иного способа ведения боевых действий, кроме перехода к стратегической обороне. Южане испытывали острую нехватку людских и материальных ресурсов, необходимых для обороны протяженных границ Конфедерации. А враг, меж тем располагал неисчислимыми людскими массами и огромным промышленным потенциалом. Если в армии южан ситуация выглядела серьезной, то в отношении военного флота она была просто ужасающей: практически весь военный флот «старых» Соединенных Штатов остался на Севере. Министр ВМС Конфедерации Стефен Мэллори столкнулся с необходимостью обеспечить оборону протяженно береговой линии силами, не идущими ни в какое сравнение с флотом северян.
Мэллори избрал путь укрепления обороны ключевых пунктов на побережье — расположенных в устьях рек портов Норфолк, Чарльстон, Саванна, Мобиль и Новый Орлеан. Захвати северяне эти порты — они смогли по рекам пройти в самое сердце Конфедерации. Исходя из потребностей береговой обороны, Мэллори строил свой флот. Южане не имели возможности превзойти северян в количестве кораблей, поэтому глава военного флота Конфедерации сделал ставку на использование передовых технологий в кораблестроении — на создании кораблей новых классов, самыми известными из которых стали броненосцы, а самым известным из броненосцев «Мэррмак/Вирджиния». Немало броненосцев было построено в расположенном на Миссисипи Ричмонде и в ряде иных мест, однако эти корабли не стали панацей. Они были неуклюжими, мощности установленных на таких кораблях машин не хватало совершенно, к тому же броненосцев банально не хватало в количественном отношении. Броненосцы интегрировали в систему береговой обороны, наступательным оружием они не стали.
Министр военного флота Конфедерации Стефен Меллори (1812–1873 г.г.) проявил себя на этом посту как выдающийся стратег и сторонник использования самой передовой техники для противоборства с численно превосходившим флот южан флот Соединенных Штатов.
Мэллори стремился найти способ прорвать блокаду, тисками которой флот северян зажал южные штаты. В те времена торпеды (по-современному) мины являлись совершенно новым видом военно-морского оружия. Мэллори организовал лучших ученых и конструкторов Юга на создание минных заграждений на реках и в районах портов. Следующим логичным шагом стала попытка превратить мины из оборонительного оружия в наступательное. В результате ряде экспериментов, местами чрезвычайно опасных, появились небольшие надводные или полупогруженные катера, вооруженные шестовыми минами, которые срабатывали при ударе шестом в борт неприятельского корабля. Так появились одни из самых необычных и весьма удачливых кораблей Гражданской войны между Севером и Югом. Катера с шестовыми минами стали прообразами торпедных катеров, миноносцев, эсминцев и даже легких крейсеров.
В ходе войны появились небольшие катера с паровыми машины, способные незамеченными подойти к борту вражеского корабля, ловко ткнуть в его борт шестовой миной, после чего проворно отойти восвояси. Во время Гражданской войны появились также подводные лодки, со временем самым радикальным образом изменившие картину войны на море. Впервые корабли сражались в трехмерном пространстве! Впервые в мире подводная лодка конфедератов «X.J1. Ханли» потопила надводный корабль. Пусть другие субмарины, как южные, так и северные, успеха не добились, зато конструкторы приступили к практическому решению проблем подплава: обеспечения экипажа и двигателей субмарины воздухом, отработке силовой установке, изучению способов подводного кораблевождения и навигации. У конструкторов катеров проблем в то время было куда как меньше, чем у конструкторов подводных лодок, а потому развитие катеров прогрессировало скорее, чем развитие субмарин.
В то же время, даже во времена Гражданской войны субмарины появлялись какой-то принципиальной новинкой. Еще Алдександр Великий погружался на дно морское в водолазном колоколе. Про Ефима Никонова давно известно всему миру. Дэвид Бушнель во времена Американской Революции 8 сентября 1776 г. атаковал на своей подводной «Черепахе» стоявший па якоре в виду Нью-Йорка британский фрегат «Игл», по не сумел его повредить. Тогда Джордж Вашингтон очень положительно отозвался о «Черепахе» и ее изобретателе, но попытки атаковать британский флот больше не предпринимались. Опыты Бушнеля вдохновили на эксперименты с подводными лодками другого американского гражданина — Роберта Фултона (1765–1815 г.г.). В годы Наполеоновских войн Фултон построил две подводные лодки, которые пытался безуспешно продать как англичанам, так и французам. В 1813 г. британский корабль подвергся неудачной атаке из-под воды в водах Нью-Лондона, шт. Коннектикут. Источник подводной угрозы установить не удалось ни тогда, не после в силу несовершенства бортового аппаратуры ПЛО того времени — на корабле отсутствовали гидрофоны и ГАС.