После уничтожения Меченым руководства организации «О-сознание», вопреки всеобщим ожиданиям, в Зоне отчуждения мало что изменилось: стихийный штурм Припяти и ЧАЭС захлебнулся, выбросы не прекратились, Выжигатель мозгов снова заработал. Спустя короткое время Меченый сгинул, попав в засаду наёмников, а некие лица из контингента НАТО начали тайное расследование последствий похода сталкера к Монолиту. Сидорович узнаёт новые факты и понимает, что имевшиеся представления о центре Зоны и секретных лабораториях далеки от реальности.